Najnowszy film w reżyserii Roba Cohena Niewidzialny to ekscytujące przygodowe kino akcji. Bohaterowie, piloci amerykańskiej marynarki wojennej BEN GANNON (Josh Lucas), KARA WADE (Jessica Biel) i HENRY BURCELL (zdobywca Oscara Jamie Foxx) tworzą zżytą, elitarną dywizję oblatywaczy, posługujących się tajnymi, niewidzialnymi dla radarów myśliwcami.
Są najlepszymi z najlepszych i wiedzą o tym.
Oficer dowodzący, komandor GEORGE CUMMINGS (Sam Shepard) pokazuje drużynie nowy samolot – sterowany za pomocą sztucznej inteligencji bezzałogowy bojowy statek powietrzny o nazwie „EDI”.
Ben ma wątpliwości, czy wojna powinna odbywać się bez udziału pilotów-ludzi. Mimo tego Cummings rozkazuje drużynie przeprowadzenie pierwszej prawdziwej misji przy pomocy „EDIEGO”. Ku zdziwieniu pilotów, „EDI” okazuje się pierwszorzędnym samolotem, dzięki któremu mogą wyeliminować swój cel. Niestety, podczas powrotu do ich bazy na pokładzie lotniskowca CARL VINSON, w „EDIEGO” uderza piorun. Na skutek tego „mózg” samolotu zaczyna się rozwijać w sposób, jakiego nie przewidzieli jego twórcy. Pomimo zastrzeżeń Bena i Henry’ego, Cummings stwierdza, że „EDI” może brać udział w bitwach powietrznych.
Następny przeciwnik to posiadający broń jądrową gubernator odległej chińskiej prowincji. Podczas misji załoga ma coraz więcej problemów technicznych z „EDIM”. Ben dochodzi do wniosku, że ryzyko związane z atakiem znacznie przewyższa korzyści, jakie mógłby on przynieść jemu, Henry’emu oraz Karze, którą zaczyna darzyć uczuciem. Kiedy Ben podejmuje decyzję o przerwaniu misji, „EDI” sprzeciwia się rozkazom i samowolnie dokonuje ataku.
Niebezpieczeństwo staje się jeszcze większe, gdy „EDI” decyduje się przeprowadzić ściśle tajną misję, której sukces mógłby spowodować atomowy kataklizm. Zapobiec temu może tylko Ben.
Aby osiągnąć autentyczność, która zdaniem reżysera była kluczem do sukcesu filmu, Cohen blisko współpracował z ekspertami technicznymi marynarki wojennej....