W filmie długometrażowym muzyka i piosenki ze ścieżki dźwiękowej składają się na ważny element historii Pokemonów. Donna Summer podkreśla przesłanie filmu balladą wyprodukowaną przez Davida Fostera, zatytuowaną również „Uwierz W Swoją Siłę”, łączącą główny motyw muzyczny filmu oraz dźwięk fletu, który słychać podczas opowiadania legendy, przechodzący następnie w wołanie głosu Lugii.
Na ścieżce dźwiękowej, wydanej przez Atlantic Records, umieszczony został także nowy materiał wielu artystów, między innymi The B-52’s, którzy przedstawiają muzyczną wersję Legendy Wyspy Shamounti, uhonorowanej Platynową Płytą irlandzkiej grupy Westlife, Dream Street, brytyjskiego zespołu dziewczęcego Devotion 2 Music, zwycięzców list przebojów muzyki pop Plus ONE, latynoskiej piosenkarki Laury Pausini, Radio Disney Youngstown występujących razem z Nobody’s Angel, młodziutkiej wokalistki Denise Lary oraz niezrównanego Weird Ala Yankovica. Ścieżka dźwiękowa zawiera ponadto muzykę zespołu O’Town, utworzonego do serialu telewizii ABC „Making the Band”, oraz Alyshy, 12-letniej sensacji odkrytej w internetowym konkursie ogłoszonym przez ważne osobistości w muzyce rozrywkowej – Davida Fostera, Carole Bayer Sager i Kenny’ego „Babyface” Edmondsa. Wokalistka Angela Via, która pojawiła się na ścieżce dźwiękowej filmu „Pokemon Film Pierwszy”, powraca z piosenką napisaną do nowego filmu, którą nagrała w dwóch wersjach językowych – angielskiej i hiszpańskiej.
