Historia „Final Fantasy: The Spirits Within” koncentruje się wokół siedmiu kluczowych bohaterów.
AKI ROSS
Bohaterką tej elektronicznej podróży jest piękna Aki Ross (głos Ming Na). Bystra jako naukowiec i pełna współczucia jako lekarz, Aki jest wrażliwa, obdarzona intuicją, elokwentna, skupiona i pełna zapału. Kiedy zostaje opanowana przez jedno z obcych stworzeń, staje się tajemnicza i zamknięta w sobie, walcząc, aby zrozumieć i opanować obcego dręczącego ją od środka.. Rezolutna, uważna i optymistyczna, ciągle szuka odpowiedzi.
GRAY EDWARDS
Gray Edwards (głos Aleca Baldwina) jest kapitanem sił militarnych i przywódcą elitarnej jednostki Deep Eyes, która przeczesuje nieużytki zagarnięte przez obcych. Gray jest zdeterminowany, skupiony, nieustraszony, mężny. Lojalny żołnierz, efektywny przywódca i godny zaufania przyjaciel, pozwala się prowadzić swojej intuicji.
DOCTOR SID
Popierający teorię ‘fali’, Dr. Sid (głos Donalda Sutherlanda), jest naukowym geniuszem. Opanowany i mądry, nie pozwala swojemu ego wkroczyć do laboratorium. Jest pełnym poświęcenia i wyobraźni myślicielem. Jego związek z Aki polega na współpracy, mentorstwie i ojcostwie. Sid jest pewny siebie, biegły w tym, co robi, jest wizjonerem z poczuciem humoru.
GENERAŁ HEIN
Generał Hein (głos Jamesa Woodsa) jest futurystyczną wersją Generała Pattona, jest dotknięty hubris i mocną wiarą w prawość swoich pobudek. Jest inteligentny, choć kieruje nim chęć zemsty. Jego rodzina zginęła w pierwszej inwazji obcych. Uważa się przede wszystkim za żołnierza. Jest arogancki i uparty, uzdolniony i nieobliczalny.
RYAN WHITTAKER
Prawa ręka Kapitana Edwardsa, Starszy Sierżant Ryan Whittaker (głos Vinga Rhamesa) jest siłą trzymającą razem oddział Deep Eyes. Nade wszystko przedkłada lojalność. Whittaker, najlepszy przyjaciel Edwardsa, jest niepokorny, przyjacielski, odważny i prawdomówny.
JANE PROUDFOOT
Niezastąpiona w Deep Eyes, Jane Proudfoot (głos Peri Gilpin), jest zdeterminowana i inteligentna. Jest szybka w akcji, i szybko wpada w gniew, ale zawsze jest gotowa do działania. Jest dumna i ma swoje zasady, i kiedy okoliczności tego wymagają, składa największą ofiarę, aby pomóc swoim rodakom.
NEIL FLEMING
Neil Fleming (głos Steve’a Buscemi) jest dyżurnym lekkoduchem jednostki Deep Eyes. Jest sprytny i zręczny, potrafi wykaraskać się z każdych opałów. Jest też sarkastyczny i ma skłonności do pesymizmu. Zawsze można na nim polegać, jest pełnym poświęcenia, niezastąpionym członkiem Deep Eyes.
