Historia zaczyna się od spotkania z trzema wiewiórkami, Alvinem, Szymonem i Teodorem, które obserwują, jak ich dom zostaje ścięty przez firmę przygotowującą choinki na święta. Drzewo - wraz z wiewiórkami - zostaje dostarczone do holu prestiżowego budynku Jett Records, kierowanej przez Iana Hawka (David Cross) firmy płytowej w Los Angeles. Ian jest dawnym kolegą Dave'a Seville'a (Jason Lee), pechowego kompozytora i twórcy piosenek, który nigdy nie stracił nadziei, że jego muzyczna wrażliwa zdolna jest stworzyć jakiś przebój.
Kiedy Dave odwiedza Jett Records, by pokazać Ianaowi nową piosenkę, zostaje brutalnie wyrzucony za drzwi. Biorąc koszyk babeczek na pocieszenie, zastanawia się nad przeszłością choinki, ustawianej w holu. Bez jego wiedzy Wiewiórki, zwabione zapachem smakowitych ciastek, włażą do koszyka i zostają zawiezione do mieszkania Davida, w którym sekretnie moszczą sobie nowe lokum.
Zanim jednak uda się powiedzieć "Alvinnnn!!!", Wiewiórki dostają amoku, zamieniając nową siedzibę w pobojowisko. Rzeczy Wiewiórek zostają ukryte pod dywanem (tylko na czas zimy, oczywiście), lokal pogrąża się w tajemniczym mroku, a mnóstwo okrągłych drobiazgów (zdaniem Szymona - rodzynek) zostało porozrzucanych wokół. Zszokowany widokiem tego, co Wiewiórki zrobiły z jego domem, Dave czeka jeszcze większe zdumienie, gdy okazuje się, że wprawdzie jego goście nie mówią, ale za to potrafią śpiewać.
Mimo cierpkiej opinii o nowych lokatorach, Dave postanawia wykorzystać sposobność połączenia swoich zdolności kompozytorskich z talentami Wiewiórek. Pierwszy owoc ich współpracy, "The Chipmunk Song (Christmas Don't Be Late)" staje się sensacją dnia, zaś Wiewiórki zyskują status supergwiazd. Ich udziałem staje się to, co należne jest gwiazdom rocka: przyjęcia, limuzyny, błyski fleszy, tłumy fanów i wywiady prasowe.
Jednocześnie Alvin, Szymon i Teodor postanawiają zmienić się w kupidynów i aranżują romantyczne spotkanie Dave'a z jego byłą dziewczyną Claire (Cameron Richardson). Ku konsternacji i zażenowania Dave'a Wiewiórki okazują się lepszymi piosenkarzami niż swatami.
Ale problemy Dave'a sięgają dalej niż stracona okazja na romans. Chciwość Iana i niezręczność Dave'a w dochodzeniu do porozumienia prowadzą do rozdźwięku między kompozytorem i jego kumplami gryzoniami. Alvin, Szymon i Teodor wyruszają w świat i lądują w kreowanym przez Iana skorumpowanym świecie współczesnej muzyki pop. Kiedy Ian próbuje wycisnąć z nich ostatnie poty, Wiewiórki uświadamiają sobie prawdziwe znaczenie lojalności, rodziny i przyjaźni. Ale czy nie jest za późno na ucieczkę od Iana i powrót do Dave'a?
