W filmie ”Obcy kontra Predator” stoczą ze sobą ostateczną walkę dwa legendarne potwory, bohaterowie serii zaliczanych do najbardziej kasowych w historii kina. Ekipa naukowców i poszukiwaczy przygód wyrusza na Antarktydę, gdzie odnajdują ukrytą głęboko pod lodem starożytną piramidę, a w niej spotykają przedstawicieli dwóch kosmicznych ras, którzy walczą ze sobą na śmierć i życie. Ktokolwiek wygra, my przegramy....
Przemysłowiec-miliarder Charles Bishop Weyland (Lance Henriksen: ”Obcy – decydujące starcie”) zbiera międzynarodową ekspedycję archeologów, naukowców i specjalistów od spraw bezpieczeństwa, na czele której staje badaczka i ryzykantka Alexa ”Lex” Woods (Sanaa Lathan: ”Wyścig z czasem”). Grupa ma zbadać niezwykłe zjawisko – nagły wzrost temperatury pod powierzchnią lodu na Antarktydzie.
Na Antarktydzie naukowcy odkrywają ukrytą 600 metrów pod powierzchnią lodu starożytną piramidę, która łączy w sobie elementy wielu kultur: azteckiej, egipskiej i kambodżańskiej. Piramida kryje w sobie labirynt komnat tak zaawansowanych technicznie, iż jasne staje się, że muszą być one dziełem przedstawicieli obcej cywilizacji, którzy zbudowali je przed tysiącami lat. Ściany jednej z komnat nieoczekiwanie zmieniają położenie, odcinając kilku członków ekspedycji od reszty ich kolegów.
Wkrótce uwięzieni w labiryncie podziemnych korytarzy badacze dokonują przerażającego odkrycia: w jednej z komnat Predatory utrzymują przy życiu matkę Obcych, która raz na sto lat składa jaja. Młode Predatory ćwiczą swe umiejętności, walcząc z młodymi Obcymi. Członkowie ekspedycji dostają się w wir niesamowitych wydarzeń – rytuału inicjacji oraz wojny między Obcymi i Predatorami.
