„Epidemia” jest dziełem autotematycznym, bliskim „8 i pół” Felliniego, quasi-dokumentalnym zapisem prac nad scenariuszem filmu, który nigdy nie powstał. Równolegle z akcją współczesną prowadzona jest, dziejąca się w nieokreślonym czasie przyszłym, historia straszliwej epidemii, której próbuje przeciwdziałać młody idealista - doktor Messmer (w tej roli sam Lars von Trier). Styl wizualny filmu w połączeniu z nawiązaniami do historycznych plag w Europie oraz europejskiej literatury, każą uznawać „Epidemię” za drugą część "trylogii europejskiej", której pozostałe ogniwa stanowią „Element zbrodni” i „Europa”.
Ten eksperymentalny utwór kręcono na przemian na taśmie 16 mm (czarno-białe partie dokumentalne) i kamerą 35 mm (kolorowe sekwencje aktorskie) z udziałem aktorów profesjonalnych i samych realizatorów - scenarzysty i reżysera.